โครโมโซมเอ็กซ์ มีการถ่ายทอดลักษณะทางพันธุกรรมที่แตกต่างกันในเพศชายและเพศหญิง คือ ในกรณีของเพศชาย โครโมโซมเอกซ์ส่วนใหญ่มักเกิดการถ่ายทอดสู่ลูกสาว และในผู้ชายโครโมโซมเอกซ์เกือบทั้งแท่งไม่เกิดรีคอมบิเนชั่นกับโครโมโซมวาย ยกเว้นบริเวณส่วนปลายของโครโมโซมวายที่เรียกว่า Psuedoautosomal region หรือ PAR ดังนั้นผู้ชายจึงมีรูปแบบการถ่ายทอดโครโมโซมเอกซ์คล้ายกับโครโมโซมวายที่ไม่มีการเกิดรีคอมบิเนชั่น ในขณะที่กรณีของเพศหญิง โครโมโซมเอกซ์สามารถถ่ายทอดผ่านทั้งทางลูกชายและลูกสาว และในระหว่างกระบวนการสร้างไข่ โครโมโซมเอกซ์จะมีการเกิดรีคอมบิเนชั่นระหว่างโครโมโซมคู่เหมือน ทำให้โครโมโซมเอกซ์บนเพศหญิงมีรูปแบบการถ่ายทอดทางพันธุกรรมคล้ายกับออโทโซม (Lahn and Page, 1999; Schaffner, 2004)