การศึกษาทางพันธุกรรมของชาวไทยใหญ่ในประเทศไทยได้รับความสนใจอย่างมาก และมีการวิจัยหลายครั้งเพื่อทำความเข้าใจถึงที่มาและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของชาวไทยใหญ่

การศึกษาที่ตีพิมพ์ในปี 2021 ระบุว่าชาวไทยใหญ่ในประเทศไทยแสดงความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่แตกต่างกันขึ้นอยู่กับภูมิภาค. 

• กลุ่มทางภาคเหนือมีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่ใกล้ชิดกับกลุ่มชาติพันธุ์ในจีนใต้ เช่น ชาวไทในจีน, กลุ่มชาติพันธุ์ออสโตรไอซีและกลุ่มชาติพันธุ์ออสโตรเนเชียนในไต้หวัน

• กลุ่มทางภาคตะวันออกเฉียงเหนือมีความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่ใกล้ชิดกับกลุ่มชาติพันธุ์ที่พูดภาษาออสโตรไอซีและกลุ่มชาติพันธุ์ที่พูดภาษาไทในลาว 

• ในขณะที่กลุ่มทางภาคกลางและภาคใต้แสดงความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมที่แข็งแกร่งกับชาวมอญในพม่า แต่กลุ่มทางภาคใต้ยังแสดงความสัมพันธ์กับกลุ่มชาติพันธุ์ที่พูดภาษาออสโตรเนเชียนในฟิลิปปินส์และกลุ่มชาติพันธุ์บางกลุ่มในมาเลเซียและอินโดนีเซีย 

การศึกษาทางพันธุกรรมเหล่านี้ช่วยให้เราเข้าใจถึงความหลากหลายทางพันธุกรรมและความสัมพันธ์ทางพันธุกรรมของชาวไทใหญ่ในประเทศไทย